През 1995 г. (с решение на Академичния съвет на ЮЗУ "Неофит Рилски") Философският факултет се обособява като самостоятелен"факултет, включващ специалностите: "Теология и философия" и "Социология".

През 1996 г. е обявен прием и по специалност "Политология".

Медико-педагогическият факултет е създаден през 1989 г. и е включвал специалностите: "Специална педагогика" (със специализации Логопедия и Педагогика за лица с интелектуална недостатъчност), "Социална педагогика" и "Социални дейности".

През м. декември 1999 г. Медико-педагогическият и Философският факултети се обединяват във Философски.